
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱生物制品 为其提供 TMT蛋清组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
科学研究没想到
探索工人探究性近年来保温时刻调长日期羊肉的强度、持水、光色、空气氧化钙水分含量铁水分含量、ROS、脂质过空气化合物、MDA、GSH和GPX4关卡来评价指标肌组织结构体细胞系的铁去世方式。没想到彰显,保温时刻调长日期后,羊肉的强度在第四天和第6天有效回落;持水水平有效降低;茶汤颜色变深,失却有光泽度,鲜大紫色改成暗大紫色。除此以外,空气氧化钙水分含量铁、活性氧氧和MDA的水分含量有效扩大,体细胞系凋亡率有效偏高。 探究拜谱生物取出其他冰箱年代的腿部肌肉组织仿品的淀粉酶质,然而来进行SDS-PAGE研究剖析,淀粉酶质条带在其他年代规划光滑且相同(图1a)。按照淀粉酶在其他仿品中的表示环境,研究剖析出现同样一组仿品的中六位数取决于于同样一质量(图1b),说明怎么写腿部肌肉组织仿品淀粉酶质具备有充分的组内相同性和组间相互影响性。 核营养素组学共监定出1996种核营养素。以B0为对应组,筛分B1、B2、B4和B6中的核核核蛋清展开与众不同表示阐述,共监定到374个DEPs。将火山图可视化管理,并结合FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05几个规则阐述DEP。导致如图甲表现1c-f表现,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分刘海别监定出22、33、73和140个DEPs,这里面分刘海别上浮6、11、32和8九个,调低16、22、41和58个。聚类算法方法步骤估评了与众不同要在冷藏室保存分阶段肩部肌群组识中核营养素的表示,导致体现肩部肌群核核核蛋清表示与众不同伴随着儲存耗时的多而多(图1g)。
图1| 各个保鲜时间段的背部肌肉印刷品血清质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 各种不同速冻准确时间的脂肪产品的样品区别蛋白酶研究分析(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁阵亡蛋白酶肽的PRM一定量浅析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 对于KEGG生物富集不一致性呈现核蛋白的铁牺牲考核机制(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱总结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱微生物提供了TMT酶联免疫法淀粉酶质组学技艺提供服务质量,拜谱怪物已开发完整并打造了建立健全稳定的转录组学、淀粉酶组学、基础代谢组学或多个学协同提供服务技艺提供服务质量体制,欢迎致电咨询!
参看论文:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.