草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿模式最经长见的重大疾病中的一种。肾组织机构中CaOx晶状体过呈现饱和状态积聚会会从而导致肾小管细胞系损害和凋亡，得以会从而导致肾结石的生成。短链蛋白质酸由肠腔内活性污泥螨虫沤肥饮食营养钎维引起，不光在部位肠腔防御操作系统中切实挥发用途，又很在模式关卡上也切实挥发根本用途。至少，丁酸是最雄厚的短链蛋白质酸，兼具消除炎症和抗体限制用途,本的研究研究综述丁酸对CaOx肾结石的用途下列不属于存在靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山医院科室泌尿普外吴忠教受、周子健博士研究生于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠院士、周子健研究生在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生物学与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了网络信息药理学学服务项目，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

篇文章命名：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 业主的单位：华山大医院 研究探讨项目：大鼠、HK-2生殖细胞 排序问题：比组（Con）、建模 组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱作为技術：无线网络临床药理学的检测

想法步骤图

探索但是

探析人士先要倡导大鼠建模 ，依据生理变化血生化质量指标和进行病检学脱色等探析方法表明丁酸可以极大减少CaOx建模 大鼠肾CaOx多晶体的建立和问题，缓和CaOx建模 大鼠的支原体感染问题和硫化有害物质的过量展现。显然，丁酸还可可以抑制草酸诱发的HK-2神经上皮细胞问题、硫化应激反应和神经上皮细胞凋亡。 为研究解析丁酸成分和靶什么是染色体系统数剧，研究解析人工从PubChem取得丁酸和丁酸酯的二维和三维图成分（图1A）。能够PharmMapper数剧库和Uniprot数剧库加工处理后共建立出11七个丁酸靶什么是染色体供进每一步解析。将什么是染色体大sql添加STRING数剧库，做出PPI系统数剧解析。Cytoscape提供了排名的前20的交通核心靶什么是染色体的全面系统数剧图，分为CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。那些交通核心什么是染色体与系统数剧中的一些什么是染色体均行为出肯定的相关的系性，反映那些什么是染色体会性激发着协作反响。GO和KEGG解析证明了丁酸交通核心什么是染色体的相关的系条件和生物技术技术学实用功能（图1C）。交通核心什么是染色体最最主要与类固醇雄抗生素回话、被氧化反响应激状态性回话、可溶性酶氧人体细胞对类固醇雄抗生素激起的反响及及对含酸性药剂学物品的反响相关的。所讲所讲，那些交通核心什么是染色体最最主要体验了被氧化反响应激状态性和对可溶性酶氧的生物技术技术反响的时候，是肾结石产生原则中至关更为重要的条件，这揭示丁酸会性在肾结石中激发更为重要反响。

图1| 丁酸格局与靶dna网上浅析(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进步经历丁酸对CaOx肾结石确确实实切靶表观遗传，调查成员来去GEO统计比对资料库对GSE73680中健康生活对应与CaOx肾结石爱美者的表观遗传差异性来去了调查。对应组与CaOx结石爱美者的重要能力差异性把你想呈现出来方式表观遗传（DEGs）检测标为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共需求到3783个表观遗传造成重要变化无常，里面3379个（89.4%）表观遗传把你想呈现出来方式调涨，404个（10.6%）表观遗传把你想呈现出来方式降低（图2A）。对DEGs来去聚类分析法分折法分折，热图出现了前10个被选中DEGs的二维上下分层聚类分析法分折法功能（图2B）。那么，调查成员在GeneCards统计比对资料库人工加工处理签定了370个概率与CaOx肾结石一些的表观遗传，排列前20位的預测表观遗传简答一些性评价下图2C如图是。从而寻到丁酸治疗方法CaOx肾结石的根本靶点，调查成员将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石一些表观遗传加工处理取到新一个Venn图。既定，CYP2C9被确认为丁酸影向CaOx肾结石的自身靶点(图2D)。除此之外，调查成员还来去了丁酸与CYP2C9的团伙连通，CYP2C9的多个蛋白质残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸共同效应，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在进行电脑网络药剂学学預测CYP2C9是丁酸不良影响CaOx肾结石的靶DNA后，研究分析人员管理还用人体神经元实验英文确认了CYP2C9可大幅度降低草酸诱导型的HK-2人体神经元的ROS品质、慢性炎症挫伤和凋亡。

图2| 越多越据库结合探讨預测CYP2C9是丁酸效用于CaOx肾结石的靶dna

探讨结局

本研究分析率先出现 丁酸在内部和内部均能促使CaOx肾结石建模的钝化应激反应反应和真菌感染病变损坏，随着顺利经由电脑网络信息药剂学学建立受到丁酸会影响CaOx肾结石的不确定性靶点——CYP2C9，最后一个顺利经由血内部实验室验证CYP2C9在草酸盐分析的HK-2血内部ROS程度、真菌感染病变损坏和凋亡。这出现 发现丁酸将顺利经由促使CYP2C9来促使CaOx肾结石的钝化应激反应反应，消减真菌感染病变损坏。这一种流程中拜谱生态学工程展示 了电脑网络信息药剂学学技術业务，于此拜谱生态学工程可增长熟更加完善的遗传基因组学、球氨基酸组学、基础代谢组学等两组学护肤品及技術业务，欢迎语详询在线咨询！ 参考使用论文：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.