
拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康硝化作用修饰语核蛋白组学产品,实现1000+玄之又玄度突显位点验出,增强重演經典靶点,全东南方向生信研究解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“发展”到“核实”全环节提供服务,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。
PART 1
01、实验英文步奏
02、亲测信息
03、经“点”初现
在评测数据显示中,检测众多学术论文中曝光的著名靶点和其衣康酸遮盖位点,如第1 个被遇到的衣康酸共价遮盖蛋清酶KEAP1,仍有糖酵解通道中的3个要点酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,还有炎性小体成分蛋清酶NLRP3和神经元挫裂方式中的要点蛋清酶RIPK3等,其质谱图相应图所显示。
04、新产品特殊性
1.强有力的加密管控质控
工业化特男人探头孵育、SDS-PAGE检验、WB认证、样品一些性深入分析等几东南方向检验,确保工程毕竟牢靠性。2.高稳定性质谱检测设备软件平台
在Orbitrap Astral全新第一代高区分质谱仪六道金刚咒下,做到衣康过酸装饰位点及蛋白酶判定新广度,帮助小学科学学习新找到。3.全步奏一坐式提供服务
针对拜谱菌物成熟的的研究APP,可具备“細胞教育培养→的在线检测器孵育→WB的在线检测→玄之又玄度衣康酸性反应掩盖的在线检测→独属生信分折→对应位点PRM效验”全步奏产品,省时杠杆原理更实惠。05、分折方式(部门)
06、技术应用路径
PART 2、文章分享图片
论文资料一
英文字母大标题:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)
常常标题文字:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析
调查资源:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。
(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)
论文参考文献二
用英语主题词:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)
2英文题头:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性
学习信息内容:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。
(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)
PART 3、例案衍化理念
蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13还具有具有的底物融合学习能力,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。
S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。
(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)
值得一提的是,在拜谱动物衣康酸性反应突显组测试数据显示数据显示中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康碱化掩盖(下述图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。
PART 4、拜谱总结
对于TCA反复中的后面分解物,衣康酸调结分解、免疫力力抗体和细菌感染当中的主动效应,为控制免疫力力抗体细菌感染性疾患可以能提供了用于控制机制。衣康酸构造中的亲电性α,β-不趋于稳定羧酸构造能对核核蛋白上的化学活化半胱氨酸残基去烷基化淡化(迈克尔暴伤症状),相应翻译资料后淡化被叫做“衣康酸淡化(itaconation)”,因而直接影响核核蛋白实用功能,房产调控免疫力力抗体对答和分解方法,为许多种疾患类药物研究开发可以能提供新总体目标。拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康酸性反应修饰语核蛋白组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物医学研究丝毫降钙素原检测靶向疗法消化吸收组(QMT1000)或正能量消化吸收靶向疗法消化吸收组软件对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!
符合文献综述
1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.